home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00433 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  39 lines
  1. ************************************
  2. * Thymosin beta-4 family signature *
  3. ************************************
  4.  
  5. Thymosin beta-4 [1] is a  polypeptide of  43 amino  acid residues whose  exact
  6. physiological role is not yet known.   It  was  first  isolated  as  a  thymic
  7. hormone that induces terminal deoxynucleotidyltransferase. It is found in high
  8. quantity in thymus and spleen  but  is  widely distributed in many tissues. It
  9. has also  been  shown  to  bind  to  actin  monomers and thus to inhibit actin
  10. polymerization [2].
  11.  
  12. The sequence of thymosin beta-4 is extremely  well  conserved  in  mammals and
  13. amphibians.  A number of peptides closely related to thymosin beta-4 are known
  14. to exist [3,4]: thymosin beta-9 (and beta-8) in bovine and pig, thymosin beta-
  15. 10 in man and rat, thymosin beta-11 and beta-12 in trout.
  16.  
  17. As a signature pattern for this family, we selected  a stretch of 11 perfectly
  18. conserved residues located  in the central part of the thymosin beta proteins.
  19. This region,  rich  in  charged  residues  (4 Lys and 2 Glu), lies between two
  20. alpha-helical regions [5] and could be involved in the binding of actin [2].
  21.  
  22. -Consensus pattern: K-L-K-K-T-E-T-Q-E-K-N
  23. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  24. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  25. -Last update: June 1992 / Text revised.
  26.  
  27. [ 1] Low T.L.K., Goldstein A.L.
  28.      Meth. Enzymol. 116:248-255(1985).
  29. [ 2] Weeds A., Way M.
  30.      Curr. Biol. 1:307-308(1991).
  31. [ 3] Horecker B.L., Erickson-Viitanen S., Hannappel E.
  32.      Meth. Enzymol. 116:265-269(1985).
  33. [ 4] Yialouris P.P., Coles B., Tsitsiloni O., Schmid B., Howell S., Aitken A.,
  34.      Voelter W., Haritos A.A.
  35.      Biochem. J. 283:385-389(1992).
  36. [ 5] Zarbock J., Oschkinat H., Hannappel E., Kalbacher H., Voelter W.,
  37.      Holak T.A.
  38.      Biochemistry 29:7814-7821(1990).
  39.